第二天，吴三桂就知道了。他和麾下的谋士武将们一商议，决定撤军。朱聿鐭到了贵阳意味着什么？当然是要对他吴三桂发动总攻了。吴三桂虽然不了解朱聿鐭的成色，但是他了解李定国，了解田见秀，了解白文选，了解袁宗第，了解高一功、了解李过，了解张鼐。这些人没有一个是省油的灯。他们中间只有一个人掌握了和自己旗鼓相当，哪怕是在数量上稍稍少一些的人马，他们都有能力和他吴三桂一较高下，并且吴三桂没有决战决胜的把握。另外还有两个理由也是促使吴三桂撤退的原因，那就是吴三桂相信朱聿鐭决然不是一般的人物，不然他不可能将这些彪悍流寇余孽都汇聚到他的麾下和吴三桂也不想给孙可望做嫁衣。对，吴三桂是决然不想给孙可望做嫁衣的。因为吴三桂心理清楚，如果他和这个朱聿鐭决一死战，无论胜败，都是自己和朱聿鐭两败俱伤，孙可望是决然不会放过这一个东山再起的机会的。所以，现在摆在吴三桂面前最好的选择就是全军撤退，保存实力。吴三桂亲自断后，胡国柱率领一部分人马撤往重庆；夏国相则率领另一部分人马撤往成都，并且他对胡国柱和夏国相说得清楚，如果贼寇以偏师追击，务必坚守城池，如果贼寇以主力攻城，可继续后撤，保宁是全军撤退的终点。吴三桂这样的部署是十分高明的，如果明军在自己主动后撤以后，攻打孙可望，那么他就可以借机稳定四川的局势，将四川牢牢的掌握在自己的手中，便于他下一次南下云贵；如果明军以主力对成都、重庆发动进攻，他就可以抢先一步，将成都、重庆的人力物力，运往川北，给明军留下一个空荡荡的川南。须知，当初张献忠占据四川的时候，军阀混战，清军的屠杀，张献忠的乱杀，四川人口十去七八，他想将川南的人口北迁，那是十分容易的。一旦川南空荡荡，就算明军占领了成都、重庆又有什么价值呢？虽然没有经济价值，但是有军事价值。一个没有经济价值的地方，别说十余万大军，就是三五万，两三万人马向站稳脚跟，也是很难的。因为无法就地征粮，仅后勤一项就能逼得明军主动后撤。吴三桂的这个算盘打得不可谓不精明啊！吴三桂不仅算盘打得精，在军事上也是一把好手，他全军在撤退了五日之后，也就是朱聿鐭抵达李定国军营的第二天，李定国方才察觉。随即，李定国陪着朱聿鐭和诸将一起去了赤水卫，查看了吴三桂留下来的空城。在赤水卫的卫所之内，朱聿鐭问道：“众位如何看待这一次吴三桂的突然撤军啊？”
李定国道：“显然，贵阳城中有吴三桂的细作。吴三桂一听说陛下进了贵阳，就是用屁股也想得到，咱们会先拿他开到，所以就溜之大吉了。”
“有道理。”
朱聿鐭微微颔首，首先肯定李定国的意见是对的，然后问道：“不过据咱们的细作，吴三桂和孙可望早已勾结到一起去了，他们为什么不一起对我军发动进攻呢？”
王自奇道：“孙可望自从僭越篡位以来，众叛亲离，他如今麾下的人马不多，吴三桂一来觉得孙可望不可信，而来也觉得孙可望靠不住。”
朱聿鐭看了一眼王自奇，问道：“这位将军是？”
王自奇跪在朱聿鐭的面前道：“罪臣王自奇拜见陛下。”
王自奇被李定国关进大牢之后，乘着夜色去监牢中探访王自奇，与他推心置腹，王自奇也就答应归顺了朱聿鐭。后来李定国为了保住王自奇的家人，将跟着王自奇同来的四名长随和一个相貌与王自奇相近的囚犯都斩首示众。孙可望以为王自奇已经被杀，也就放过了王自奇的满门老幼。然后李定国派细作进了石阡，将王自奇的家人都悄悄的接来了贵阳。“哦，是王将军啊。快快请起，快快请起。”
朱聿鐭笑道：“以往咱们在战场上相见，那是清清白白，如今咱们是姑舅老表，那就是难舍难分了。请王将军接着说。”
王自奇接着道：“孙可望和吴三桂之间，其实就是相互利用。吴三桂想让孙可望与我大明拼得两败俱伤，而孙可望也想吴三桂和我大明拼得两败俱伤，不要说现在孙可望没有多少人马，就算有，他的人马越多，吴三桂越是忌惮。”
王自奇对孙可望军中的情况最了解，所以他说的话是有重要参考价值的。朱聿鐭又问众人道：“那依大家看，咱们是先追击吴三桂还是还是先收拾了孙可望啊？”
李过首先说话：“当然是追击吴三桂！”
一向紧开口慢开言的张鼐也急不可耐的叫道：“补之大哥说得对，先追击吴三桂，不能放这个狗杂碎走脱了！”
袁宗第拱手道：“陛下，追击吴三桂俺愿为先锋！”
朱聿鐭没有马上表明态度，因为在场的人都知道，闯军打吴三桂是急于报山海关之仇，如果要先打孙可望的话，那就需得征求大西军诸将的意见，于是问李定国、白文选和马元利道：“宇宁、毓公、老马，你们怎么看呢？”
李定国道：“先打孙可望。”
朱聿鐭道：“说说理由。”
李定国拱手道：“攘外必先安内。打掉了孙可望，这大明的天下便只有陛下这一位真龙天子，从今往后，天下的明人才能全部都归附到陛下的麾下，齐心协力，共抗建虏。”
堵胤锡跪倒在地道：“陛下，微臣以为，李总帅之议实乃当务之急，请陛下恩准！”
苏观生拱手道：“微臣附议！”
“毓公，老马，你们也说说你们的看法。”
白文选道：“微臣也以为应当先打孙可望。自从前番温甫从四川败还——老马，我还请你不要误会，我没有别的意思。吴三桂在四川也经营了半年有余，如今他退回成都和重庆，依托长江水道之便利，互为犄角，急切难下。我军追击吴三桂，人马去得少了不济事，人马去得多了，孙可望则有攻打我军后路之可能，一旦如此，那边等于我军促成了吴三桂和孙可望的配合，实不利于我军下一步的发展。现在我军应当乘着吴三桂收缩之机，先破孙可望，而后徐图吴三桂。”