第九军和第十一军由李定国统一指挥，防止贼军向山西流窜，并随时准备出动，截断贼军退路。同时命令驻防保定的李过的第六军；驻防正定刘芳亮的第八军；驻防大名府刘体纯的第十五军，由田见秀统一指挥，或进或退，随时听候调用。另，命令刘文秀将起麾下主力屯驻陕北，兵准备好渡河船只与架设浮桥器材，随时听候调用。朱聿鐭是深夜回到北京的，此时的北京城已经戒严。重要的街道口都站着义勇军的士兵，盘查偶尔过往的行人。另有义勇军在城中往来巡逻。巡逻和站岗的义勇军都是北京本地人，甚至都是住在附近的人，这样安排的目的就是为了能够更好的搜捕奸细。所有的客栈、酒店也加紧了甄别住宿客人的身份，但有怀疑，也不抓捕，而是将这些人全部都集中在一间客栈之中，便于统一管理和监督。家家户户的大门外都挂着红色的或白色的纸灯笼，将门前的道路照亮，便于义勇军巡逻。第四军的大炮已经在北京城头部署完毕，另有一部分炮兵和步兵驻守在通州。三千骑兵作为全军的机动力量，驻扎在永定门外，随时策应各处的厮杀。御林军原本是驻守紫禁城的，但是根据龙映真的要求，一部分御林军被调上了北京城头。杨廷麟不同意龙映真的这个决定，他的理由很简单，北京是大明的心脏，而紫禁城是北京的心脏，如果城中有贼兵的奸细突然作乱，而御林军不在紫禁城，如何应对？龙映真则坚持要让御林军蹬城。她的理由也很简单，北京又失，区区千余御林军是守不住紫禁城的。至于说奸细进城，这是有可能的，但是几百几千奸细进城，还能攻打紫禁城，这种可能性几乎为零。所以，只要有几百御林军在紫禁城的城头巡逻就可以了。另外，御林军蹬城守卫，也可以让北京的百姓和第四军的官兵知道，大明皇帝陛下是和他们在一起的。朱聿鐭回到北京之后，没有进紫禁城，而是直接上北京城头。而这个时候，大明的皇后和大明的太子正在高一功、马元利的陪同下在城上与兵士们一起巡逻，当兵士看见皇帝陛下也蹬城以后，欢呼万岁之声，不绝于耳。随后，朱聿鐭一行人正要返回紫禁城，突然听见通州方向炮声隆隆，众人看去，通州方向火光冲天。郑成功道：“贼兵开始攻打通州了。”
朱聿鐭问道：“通州有多少人马？”
高一功回答道：“回禀陛下，军帅张鼐领着五千人马和一万五千义勇军防守通州。”
朱聿鐭问道：“你们怎么和张鼐联系？”
高一功道：“回禀陛下，微臣们一得到贼兵又进犯京师的迹象，张鼐便去了通城，并且在通州南面抢建了两座城堡，城堡和通州之间以吊桥联通，这样的话，贼兵想将以少数人马两通州围死就不可能了。所以除非贼兵以全部人马围困通州，不然京师随时可以和通州保持联系。”
朱聿鐭微微颔首，表示满意，问道：“你们觉得贼兵有可能越过通州，直接来攻打京师吗？”
高一功回答：“极有可能。”
“元利，你看呢？”
马元利道：“微臣估计不错的话，三日之内贼兵必来。”
朱聿鐭道：“传我圣旨，半个月内，不许一人出城迎战。”
“遵旨。”
第二天早上，像往常一样，天不明他就起床，在一群宫女的服侍下梳洗好，着一身暗龙黄缎便袍，先传免了皇后、太子、妃嫔和公主等的照例请安，然后传在京师的军机大臣来养心殿议事。不一会儿，杨廷麟、高一功、马元利和白文选都到了。昨天晚上白文选之所以没有蹬城寻路，是因为他最近病了，今天刚刚好了一些，皇帝召见，他就立刻到了。“毓公——”白文选揉了揉鼻子道：“微臣在。”
朱聿鐭问道：“病好些了吗？”
“回禀陛下，已经好多了。”
朱聿鐭道：“毓公，你是我们中年最年长的一位，就不要四处奔波了，这样吧，你就留在我的身边，帮助我统筹全局，怎么样？”
白文选道：“多谢陛下。”
“延平郡王。”
“微臣在。”
郑成功赶忙回应。“被动东南两面就给你来防守。”
“微臣遵旨。”
“元利。”
“微臣在。”
“西北两面就交给你。”
“请陛下放心。”
“伯祥。”
“微臣在。”
朱聿鐭道：“统筹粮草和动员城中除了义勇军以外的所有劳力就交给你了。尤其是粮草，要施行供给制，每人每天按量供应。”
杨廷麟道：“微臣遵旨。”
朱聿鐭问道：“城中的粮食能用多久？”
杨廷麟道：“回禀陛下，城中的粮食可供全城一年之用。”
“很好。”
有了充足的粮食供应，朱聿鐭就放心，笑道：“那就耗着吧，这一回务必要将所有进犯的贼兵歼灭在北京城下。”
忽然，朱聿鐭又想到了一个问题，问道：“你们说说，如果贼兵在无法攻下北京城以后，会不会南下？毓公，你先说说看。”
白文选想了想道：“陛下，这种可能性是非常大的，尤其是在贼兵的粮草不足之后，贼兵极有可能南下劫掠。”
杨廷麟不无忧虑的道：“如今将近秋收，如果贼兵南下，那北直隶今年的收成恐怕难保啊。”
马元利知道朱聿鐭的心思，道：“杨相所言确有可能。但是，如果能一举歼灭十万贼兵，损失一些粮食的收成，也是值得的。”
郑成功道：“微臣看未必会有损失。”
“哦？”
对于郑成功的说法让朱聿鐭来了兴趣，问道：“何以见得啊？”
郑成功道：“贼兵如果南下，可以让他们先收，收了那也得有命来享用才是正经。”
朱聿鐭道：“你的意思是他们刚一收完粮食咱们就动手吗？”
“微臣就是这个意思。”